WhatsApp umožní manuálne overiť stav šifrovania četu. Aplikácia používa end-to-end šifrovanie pre všetky správy, médiá a funkcie od zavedenia tejto funkcie v roku 2016. Systém zabezpečuje, že správu nemôže dekódovať nikto iný, dokonca ani samotný WhatsApp.