Kybernetická bezpečnosť Národného centra zdravotníckych informácií (NCZI) je podľa audiu Národného bezpečnostného úradu (NBÚ) nedostatočná. Problematická je nedostatočná ochrana osobných údajov, ako aj ochrana pred kyberútokmi z dôvodu využívania zastaraných technológií a chýbajúcich bezpečnostných prvkov.