Známy producent podnikového softvéru a aplikácií, spoločnosť SAP, sa bude podieľať na vytvorení rozsiahlej databázy biologických druhov. Všetky (známe) živočíšne a rastlinné druhy na svete majú dostať čiarový kód s informáciami o DNA. Spoločnosť SAP totiž odštartovala spoluprácu s International Barcode of Life na vytvorení Big Data aplikácií na ochranu celosvetovej biodiverzity. S ich pomocou dokážu profesionálni aj amatérski vedci lepšie mapovať ohrozené druhy, ale aj zdieľať a analyzovať ich DNA informácie.
Konzorcium International Barcode of Life (iBOL) zahŕňa inštitúcie z 25 štátov, vrátane Kanady, USA, Nemecka a Číny. SAP a iBOL teraz spolupracujú na vytvorení platformy a aplikáciách na základe Big Data, ktoré by zbierali, uchovávali, analyzovali a zdieľali DNA dáta všetkých druhov sveta. Cieľom je zmapovať pol milióna druhov do konca roku 2015.
Pozn. TECHBOX.sk: Hovoriť o zmapovaní všetkých druhov sveta je možné len v prenesenom význame. Všetky biologické druhy totiž zďaleka nepoznáme a nie je dokonca stanovený ani jednotný odhad ich počtu. Toto číslo sa pohybuje v rozmedzí od päť do päťdesiat miliónov.
Táto platforma by mala napomôcť ochrane globálnych ekosystémov a bude reagovať na enviromentálne a ekologické obavy. Umožní totiž sledovanie globálnej diverzity v agroekosystémoch, kontrolu kvality jedla, identifikáciu ohrozených a sledovanie inváznych živočíchov a rastlín.
„Vytvorenie otvorenej databázy, obsahujúcej referenčné DNA sekvencie pre každý druh, je rozhodujúce na ich identifikáciu a ochranu a na ochranu globálnych ekosystémov,“ povedal Dr. Paul Hebert, riaditeľ Inštitútu biodiverzity Ontaria. „Tým, že spolupracujeme so spoločnosťou SAP, nachádzame inovatívne spôsoby využitia Big Data a mobilných technológií na získavanie, analýzu a zdieľanie informácií o jednotlivých druhoch a ich prirodzenom prostredí v globálnom meradle.“
Prvá aplikácia užívateľského typu umožní spoluprácu pri zbieraní vzoriek DNA. Amatérski vedci vďaka nej budú môcť poskytovať vzorky hmyzu a rastlín výmenou za identifikáciu a detailné informácie o organizme. Aplikácia je prvým krokom na ceste k identifikácii DNA priamo z mobilného zariadenia, čo by celosvetovo umožnilo získanie, vyhľadávanie a zdieľanie DNA jednotlivých druhov. Konečným cieľom je využitie súčasných inovácií spoločnosti SAP pri analýze a pokročilej analýze genómu. Aplikácie a mobilné technológie, založené na Big Data, ako aj sekvenčné spracovanie DNA ďalšej generácie sa použijú pri tvorbe platformy na skúmanie vzoriek DNA v reálnom čase kdekoľvek vo svete.
Podľa informácií o projekte Barcode of Life na stránke www.boldsystems.org, je v súčasnosti popísaný len zlomok známych druhov: 140 172 živočíchov, 51 841 rastlín a 3 448 húb a iných foriem života. Ak zároveň vezmeme do úvahy, že veľký počet druhov – hlavne rastlín a bezstavovcov – dodnes ani nepoznáme, databáza iBOL zďaleka nebude „Noemovou archou“ všetkého života na Zemi. Napriek tomu ide o zaujímavý projekt, ktorý svojím rozsahom zatiaľ nemá obdobu.
Foto: International Barcode of Life